Mustekalan ruumis koostuu vaipasta, päästä ja lonkeroista. Vaippa sisältää mm. niiden kolme sinistä verta pumppaavaa sydäntä. Niiden ruumiin ainoa kova osa on papukaijamainen nokka.

Mustekalat ovat arkoja ja syrjäänvetäytyviä. Ne ovat myös älykkäitä ja pystyvät mm. avaamaan purkkeja – kun annetaan tarpeeksi aikaa, jopa lapsilukolla varustettuja. Ne myös tunnistavat hoitajansa ja saattavat kastella vesisuihkulla niitä joskus kaltoin kohdelleen.

Mustekalojen ruumis on melko suojaton, ne ovat voimiltaan heikkoja ja väsyvät nopeasti. Näistä syistä niille on kehittynyt erilaisia suojautumiskeinoja saalistajia vastaan pidentämään mustekalan muutenkin lyhyttä elämää (6 kk - 5 vuotta):